PSA: Protein Sequence Analyzer


# Position wise entropy calculated on the MSA data
# Residue at position with higher entropy is lesser conserved.
# ============================================================

# Position        Entropy    Consensus-residue
         1        0.00000                    S
         2        0.03148                    A
         3        0.00000                    V
         4        0.00000                    K
         5        0.00000                    R
         6        0.00000                    T
         7        0.00000                    I
         8        0.00000                    K
         9        0.00000                    G
        10        0.03148                    T
        11        0.00000                    H
        12        0.00000                    H
        13        0.00000                    W
        14        0.00000                    L
        15        0.00000                    L
        16        0.00000                    L
        17        0.00000                    T
        18        0.00000                    I
        19        0.00000                    L
        20        0.00000                    T
        21        0.00000                    S
        22        0.00000                    L
        23        0.00000                    L
        24        0.03148                    V
        25        0.00000                    L
        26        0.00000                    V
        27        0.00000                    Q
        28        0.00000                    S
        29        0.00000                    T
        30        0.00000                    Q
        31        0.00000                    W
        32        0.00000                    S
        33        0.00000                    L
        34        0.00000                    F
        35        0.00000                    F
        36        0.00000                    F
        37        0.18352                    L
        38        0.00000                    Y
        39        0.00000                    E
        40        0.00000                    N
        41        0.00000                    A
        42        0.00000                    F
        43        0.00000                    L
        44        0.00000                    P
        45        0.00000                    F
        46        0.00000                    A
        47        0.00000                    M
        48        0.00000                    G
        49        0.00000                    I
        50        0.00000                    I
        51        0.00000                    A
        52        0.00000                    M
        53        0.00000                    S
        54        0.00000                    A
        55        0.00000                    F
        56        0.00000                    A
        57        0.00000                    M
        58        0.00000                    M
        59        0.00000                    F
        60        0.00000                    V
        61        0.00000                    K
        62        0.00000                    H
        63        0.00000                    K
        64        0.00000                    H
        65        0.00000                    A
        66        0.00000                    F
        67        0.00000                    L
        68        0.00000                    C
        69        0.00000                    L
        70        0.00000                    F
        71        0.00000                    L
        72        0.00000                    L
        73        0.00000                    P
        74        0.00000                    S
        75        0.00000                    L
        76        0.00000                    A
        77        0.69310                    A
        78        0.00000                    V
        79        0.00000                    A
        80        0.00000                    Y
        81        0.00000                    F
        82        0.00000                    N
        83        0.00000                    M
        84        0.00000                    V
        85        0.00000                    Y
        86        0.00000                    M
        87        0.00000                    P
        88        0.00000                    A
        89        0.00000                    S
        90        0.00000                    W
        91        0.00000                    V
        92        0.00000                    M
        93        0.00000                    R
        94        0.00000                    I
        95        0.00000                    M
        96        0.00000                    T
        97        0.00000                    W
        98        0.00000                    L
        99        0.00000                    D
       100        0.00000                    M
       101        0.00000                    V
       102        0.00000                    D
       103        0.00000                    T
       104        0.00000                    S
       105        0.00000                    L
       106        0.00000                    S
       107        0.00000                    G
       108        0.00000                    F
       109        0.00000                    K
       110        0.00000                    L
       111        0.00000                    K
       112        0.00000                    D
       113        0.00000                    C
       114        0.00000                    V
       115        0.00000                    M
       116        0.00000                    Y
       117        0.00000                    A
       118        0.00000                    S
       119        0.00000                    A
       120        0.00000                    V
       121        0.00000                    V
       122        0.00000                    L
       123        0.00000                    L
       124        0.00000                    I
       125        0.00000                    L
       126        0.00000                    M
       127        0.00000                    T
       128        0.00000                    A
       129        0.00000                    R
       130        0.00000                    T
       131        0.00000                    V
       132        0.00000                    Y
       133        0.00000                    D
       134        0.00000                    D
       135        0.00000                    G
       136        0.00000                    A
       137        0.00000                    R
       138        0.00000                    R
       139        0.00000                    V
       140        0.00000                    W
       141        0.00000                    T
       142        0.03148                    L
       143        0.00000                    M
       144        0.00000                    N
       145        0.00000                    V
       146        0.00000                    L
       147        0.00000                    T
       148        0.00000                    L
       149        0.54425                    V
       150        0.00000                    Y
       151        0.00000                    K
       152        0.00000                    V
       153        0.00000                    Y
       154        0.00000                    Y
       155        0.00000                    G
       156        0.00000                    N
       157        0.00000                    A
       158        0.00000                    L
       159        0.00000                    D
       160        0.03148                    Q
       161        0.00000                    A
       162        0.00000                    I
       163        0.00000                    S
       164        0.03148                    M
       165        0.00000                    W
       166        0.00000                    A
       167        0.00000                    L
       168        0.00000                    I
       169        0.00000                    I
       170        0.00000                    S
       171        0.00000                    V
       172        0.00000                    T
       173        0.00000                    S
       174        0.00000                    N
       175        0.00000                    Y
       176        0.00000                    S
       177        0.00000                    G
       178        0.00000                    V
       179        0.00000                    V
       180        0.00000                    T
       181        0.47889                    T
       182        0.00000                    V
       183        0.00000                    M
       184        0.00000                    F
       185        0.00000                    L
       186        0.00000                    A
       187        0.00000                    R
       188        0.00000                    G
       189        0.00000                    I
       190        0.00000                    V
       191        0.00000                    F
       192        0.00000                    M
       193        0.00000                    C
       194        0.00000                    V
       195        0.00000                    E
       196        0.00000                    Y
       197        0.00000                    C
       198        0.00000                    P
       199        0.00000                    I
       200        0.00000                    F
       201        0.00000                    F
       202        0.00000                    I
       203        0.00000                    T
       204        0.00000                    G
       205        0.00000                    N
       206        0.00000                    T
       207        0.00000                    L
       208        0.00000                    Q
       209        0.00000                    C
       210        0.00000                    I
       211        0.00000                    M
       212        0.00000                    L
       213        0.00000                    V
       214        0.00000                    Y
       215        0.00000                    C
       216        0.00000                    F
       217        0.00000                    L
       218        0.00000                    G
       219        0.00000                    Y
       220        0.00000                    F
       221        0.00000                    C
       222        0.00000                    T
       223        0.00000                    C
       224        0.00000                    Y
       225        0.00000                    F
       226        0.00000                    G
       227        0.00000                    L
       228        0.00000                    F
       229        0.00000                    C
       230        0.00000                    L
       231        0.00000                    L
       232        0.00000                    N
       233        0.00000                    R
       234        0.00000                    Y
       235        0.00000                    F
       236        0.00000                    R
       237        0.00000                    L
       238        0.00000                    T
       239        0.00000                    L
       240        0.00000                    G
       241        0.00000                    V
       242        0.00000                    Y
       243        0.00000                    D
       244        0.00000                    Y
       245        0.00000                    L
       246        0.00000                    V
       247        0.00000                    S
       248        0.00000                    T
       249        0.00000                    Q
       250        0.00000                    E
       251        0.00000                    F
       252        0.00000                    R
       253        0.00000                    Y
       254        0.00000                    M
       255        0.00000                    N
       256        0.00000                    S
       257        0.00000                    Q
       258        0.00000                    G
       259        0.00000                    L
       260        0.00000                    L
       261        0.00000                    P
       262        0.00000                    P
       263        0.00000                    K
       264        0.00000                    N
       265        0.00000                    S
       266        0.00000                    I
       267        0.00000                    D
       268        0.00000                    A
       269        0.00000                    F
       270        0.00000                    K
       271        0.00000                    L
       272        0.00000                    N
       273        0.00000                    I
       274        0.00000                    K
       275        0.00000                    L
       276        0.00000                    L
       277        0.00000                    G
       278        0.00000                    V
       279        0.00000                    G
       280        0.00000                    G
       281        0.00000                    K
       282        0.00000                    P
       283        0.00000                    C
       284        0.00000                    I
       285        0.00000                    K
       286        0.00000                    V
       287        0.00000                    A
       288        0.00000                    T
       289        0.00000                    V
       290        0.00000                    Q